<HTML>
<HEAD>
<TITLE>Re: [Beowulf] 1 multicore machine cluster</TITLE>
</HEAD>
<BODY>
<FONT FACE="Calibri, Verdana, Helvetica, Arial"><SPAN STYLE='font-size:11pt'><BR>
<BR>
<BR>
On 4/24/09 8:07 AM, &quot;Jonathan Aquilina&quot; &lt;<a href="eagles051387@gmail.com">eagles051387@gmail.com</a>&gt; wrote:<BR>
<BR>
</SPAN></FONT><BLOCKQUOTE><FONT FACE="Calibri, Verdana, Helvetica, Arial"><SPAN STYLE='font-size:11pt'>in a way arent multicore processors taking for example 4 single core<BR>
machines and merging them into one with 1 for core processor?<BR>
<BR>
</SPAN></FONT></BLOCKQUOTE><FONT FACE="Calibri, Verdana, Helvetica, Arial"><SPAN STYLE='font-size:11pt'><BR>
I think the term &#8220;node&#8221; is a loaded term in HPC. &nbsp;This is what comes to mind when I hear node, and I&#8217;m sure a lot of other people think the same: &nbsp;A node is a physical building block of a cluster. &nbsp;It has an operating system, it probably has some kind of daemon running to launch jobs submitted to a batch system. &nbsp;It is managed as a single unit, but may contain many processors &amp; cores. &nbsp;I don&#8217;t think anyone in the HPC field would say that a cluster of 128 systems with 8 cores per system is a 1024 node cluster. They would say it is a 128 node cluster with 1024 cores. It has 128 operating system instances running, 128 pbs_moms, etc. &nbsp;Calling it a 1024 node cluster is misleading. &nbsp;Much of the management here tend to confuse node with core, but we&#8217;re a genetics research laboratory and most people don&#8217;t have a background in this.<BR>
</SPAN></FONT><BLOCKQUOTE><FONT FACE="Calibri, Verdana, Helvetica, Arial"><SPAN STYLE='font-size:11pt'><BR>
<BR>
On 4/24/09, Glen Beane &lt;<a href="Glen.Beane@jax.org">Glen.Beane@jax.org</a>&gt; wrote:<BR>
&gt;<BR>
&gt;<BR>
&gt;<BR>
&gt; On 4/24/09 3:03 AM, &quot;Jonathan Aquilina&quot; &lt;<a href="eagles051387@gmail.com">eagles051387@gmail.com</a>&gt; wrote:<BR>
&gt;<BR>
&gt; im impressed with the different views everyone has. i dont know how many of<BR>
&gt; you would agree with me a multicore processor lets say a quad is 4 nodes in<BR>
&gt; one. could one say it like that?<BR>
&gt;<BR>
&gt; I would not. &nbsp;To me a node is a physical thing. &nbsp;One or more processor(s),<BR>
&gt; RAM, running its own OS instance. &nbsp;I have a cluster of N nodes with M cores<BR>
&gt; per node, or N*M total cores.<BR>
&gt;<BR>
&gt; In your example, N is 1 and M is 4.<BR>
&gt;<BR>
&gt; One thing that annoys me is when an intern working on an MPI program keeps<BR>
&gt; saying &quot;node&quot; when they really mean MPI rank since we are long past the days<BR>
&gt; where we have a 1 to 1 mapping between MPI ranks and nodes (we don't do any<BR>
&gt; kind of hybrid thing where we have 1 multi-threaded process per node).<BR>
&gt;<BR>
&gt;<BR>
&gt;<BR>
&gt; --<BR>
&gt; Glen L. Beane<BR>
&gt; Software Engineer<BR>
&gt; The Jackson Laboratory<BR>
&gt; Phone (207) 288-6153<BR>
&gt;<BR>
&gt;<BR>
<BR>
<BR>
--<BR>
Jonathan Aquilina<BR>
<BR>
</SPAN></FONT></BLOCKQUOTE><FONT FACE="Calibri, Verdana, Helvetica, Arial"><SPAN STYLE='font-size:11pt'><BR>
-- <BR>
Glen L. Beane<BR>
Software Engineer<BR>
The Jackson Laboratory<BR>
Phone (207) 288-6153<BR>
<BR>
</SPAN></FONT>
<br />-- 
<br />This message has been scanned for viruses and
<br />dangerous content by
<a href="http://www.mailscanner.info/"><b>MailScanner</b></a>, and is
<br />believed to be clean.
</BODY>
</HTML>