<HTML>
<HEAD>
<TITLE>Re: [Beowulf] Please help to setup Beowulf</TITLE>
</HEAD>
<BODY>
<FONT FACE="Calibri, Verdana, Helvetica, Arial"><SPAN STYLE='font-size:11pt'><BR>
<BR>
<BR>
On 2/20/09 10:22 AM, &quot;Reuti&quot; &lt;<a href="reuti@staff.uni-marburg.de">reuti@staff.uni-marburg.de</a>&gt; wrote:<BR>
<BR>
</SPAN></FONT><BLOCKQUOTE><FONT FACE="Calibri, Verdana, Helvetica, Arial"><SPAN STYLE='font-size:11pt'>Am 20.02.2009 um 14:36 schrieb Prentice Bisbal:<BR>
<BR>
&gt; Bill Broadley wrote:<BR>
&gt;&gt; SGE does seem the default for<BR>
&gt;&gt; many small/medium clusters these days (and is the Rocks default) <BR>
&gt;&gt; but does make<BR>
&gt;&gt; some things strangely hard, usually with a work around though. &nbsp;In <BR>
&gt;&gt; particular<BR>
&gt;&gt; I find the lack of a straight forward way to handle requesting <BR>
&gt;&gt; nodes and<BR>
&gt;&gt; processors per node strange.<BR>
&gt;<BR>
&gt; Me, too. Users are asking me for ppn=x functionality like Torque/PBS<BR>
&gt; has, and I'm finding pretty complicated to implement on SGE.<BR>
<BR>
Well, you have to setup nearly identical PEs like openmpi2, openmpi4 <BR>
with a fixed allocation rule of 2 or 4 respectively.<BR>
<BR>
OTOH: Once I looked into Torque and found, that with &quot;nodes=2:ppn=2&quot; <BR>
I got just one node with 4 slots in total of course. I don't know, <BR>
whether it can still happen to get such a distribution.<BR>
<BR>
<BR>
</SPAN></FONT></BLOCKQUOTE><FONT FACE="Calibri, Verdana, Helvetica, Arial"><SPAN STYLE='font-size:11pt'>yes, &nbsp;you certainly can get such a distribution with torque. &nbsp;Moab and Maui can be configured to remap a nodes=X:ppn=Y to some other configuration to improve utilization, &nbsp;but you can turn that feature off and then the user gets precisely the distribution that they request. &nbsp;As far as I know work is being done to allow the behavior to be chosen at submit time. <BR>
<BR>
<BR>
<BR>
-- <BR>
Glen L. Beane<BR>
Software Engineer<BR>
The Jackson Laboratory<BR>
Phone (207) 288-6153<BR>
<BR>
</SPAN></FONT>
<br />-- 
<br />This message has been scanned for viruses and
<br />dangerous content by
<a href="http://www.mailscanner.info/"><b>MailScanner</b></a>, and is
<br />believed to be clean.
</BODY>
</HTML>